In den späten 90er Jahren hat ein von der Earth Defense Force Sky Force betriebenes Weltraumzentrum im Orbit eine Zeremonie zum "J-Project" in Auftrag gegeben. Angeführt von Commander Aya Odagiri, die fünf Beamte ausgewählt hat, die den "Birdonic Waves" ausgesetzt sind, einer neu entwickelten Technologie, die einem Menschen Superfähigkeiten verleihen kann. Zu den Themen des Projekts gehört Ryu Tendoh, der als erster Freiwilliger den Birdonic Waves ausgesetzt ist und damit das erste nominierte Mitglied des neu gegründeten Jetman-Teams wird. Die anderen vier Subjekte waren im Begriff, denselben Wellen wie Ryu ausgesetzt zu sein, bis das Weltraumzentrum von den Vyram angegriffen wurde, einer bösen außerdimensionalen Organisation, die auf interdimensionale Herrschaft aus war. Die Vyram zerstören erfolgreich das Weltraumzentrum und töten die meisten Menschen an Bord. Nach der Zerstörung wurden die restlichen Birdonic Waves, die für die jetzt toten vier Beamten bestimmt waren, auf der Erdoberfläche verstreut. Er traf vier verschiedene Zivilisten, die ihrem täglichen Leben nachgingen. Odagiri und Tendoh, die erfolgreich aus dem Weltraumzentrum des Untergangs entkommen waren, begannen bald mit der Suche nach den vier verbleibenden Menschen mit Birdonic Waves auf der Erde, um das Jetman-Team vollständig zu bilden. Die Bildung des Teams wird keine leichte Aufgabe sein, da die vier Zivilisten keine vorherige Ausbildung in militärischer Taktik hatten und lernen müssen, zusammenzuarbeiten und ihre persönlichen Probleme zu überwinden, wenn sie bereit sind, die Erde vor den Vyram zu retten, die von dem grausamen Grafen angeführt wurden Radiguet.