El juego comienza con Vahn, Adrianna y Kromlech llegando a Baldur's Gate, tras lo cual son atacados por un grupo de ladrones liderados por Karne (con la voz de Michael Bell). Los ladrones están a punto de matar al trío cuando son interrumpidos por la guardia de la ciudad, que lleva a los recién llegados a la cercana Elfsong Tavern para recuperarse. Allí, la camarera, Alyth Elendara (Jennifer Hale), los ayuda a ganar algo de dinero dándoles el trabajo de limpiar el sótano de la taberna de ratas. En el sótano, descubren que los ladrones están usando la entrada de la alcantarilla de la taberna para infiltrarse en la ciudad. Cuando el empleado de Elfsong Tavern, Ethon, los sigue a las alcantarillas y desaparece, aceptan la súplica de Alyth de encontrarlo. Rescatan a Ethon de los ladrones y él los dirige a las criptas cercanas, adonde se dirigía uno de los ladrones. Allí se encuentran con Fayed (Cam Clarke), un sacerdote de Illmater, que solicita su ayuda para detener el "Orbe de los no muertos", que ha llenado las criptas con zombis y esqueletos. Ellos triunfaron ...