En The Crime of Father Amaro, la historia sigue a un joven sacerdote llamado Amaro que es enviado a un pequeño pueblo en México. A medida que se integra en la comunidad, comienza a experimentar tentaciones y conflictos morales.
Amaro se enamora de una joven llamada Amelia, lo que lo lleva a cuestionar su fe y sus votos sacerdotales. Mientras tanto, se ve envuelto en una serie de escándalos y corrupción dentro de la iglesia local.
La película aborda temas como la hipocresía religiosa, la lucha interna entre el deseo y la moralidad, y la corrupción en las instituciones de poder. Amaro se ve obligado a enfrentar las consecuencias de sus acciones y tomar decisiones que pondrán a prueba su fe y su integridad.