El programa de televisión de ciencia ficción "Stranger Than Fiction", con su carismático presentador Jack Strange, emite su último episodio. Este preludio presenta un incidente clasificado que supuestamente tuvo lugar en una escuela secundaria en algún lugar de Asia.
La historia presenta a cinco estudiantes inadaptados que asisten a una detención el sábado por la noche. La chica skater Stanlei, Zack el nerd, Tammy la popular, Keiko la estudiante de intercambio japonesa y Omar el deportista.
Stanlei visita al excéntrico profesor de ciencias, el Profesor Rosencrantz, y después de una extraña discusión que involucra tostadas, las leyes de la gravedad y gatos, se dirige a la detención. Entra justo cuando el subdirector Sr. Hughes concluye su conferencia sobre el comportamiento de los estudiantes como resultado de su castigo.
Después de un feo intercambio de palabras entre Stanlei y el Sr. Hughes, éste deja a los estudiantes para que continúen con su detención. A medida que avanza la noche, un grupo de élite de alienígenas Space Ninjas invade la escuela aislada persiguiendo a los estudiantes.
El grupo se encuentra con un Sr. Hughes muy muerto y una vez más se encuentran huyendo por sus vidas mientras los asesinos ninja del espacio los persiguen. A medida que la caza continúa, el número de muertos aumenta, con cada estudiante siendo asesinado uno por uno.
Los estudiantes restantes buscan ayuda del Profesor Rosencrantz. Juntos descifran por qué está sucediendo esto y diseñan un plan de escape. Pero los ninjas comienzan a acercarse a los últimos miembros sobrevivientes para un enfrentamiento final.