En The Witch: Part 1 - The Subversion, una joven llamada Ja-yoon despierta en un laboratorio sin recordar quién es ni cómo llegó allí. Después de escapar, descubre que tiene habilidades sobrenaturales que la convierten en una poderosa arma.
Ja-yoon intenta llevar una vida normal, pero su pasado la alcanza cuando un grupo de misteriosos hombres la persigue. Pronto se ve envuelta en una conspiración que la obliga a enfrentar su verdadera identidad y el oscuro propósito detrás de sus poderes.
Con la ayuda de un extraño llamado Cheol-min, Ja-yoon se adentra en un mundo de secretos y traiciones, donde descubre la verdad sobre su origen y el peligro que representa para aquellos que la rodean.
Enfrentada a decisiones difíciles y enemigos poderosos, Ja-yoon debe descubrir quién es en realidad y qué papel juega en el conflicto que amenaza con destruir todo lo que conoce.