Ils sont appelés Chiroptères, des créatures voraces qui peuvent changer de forme, se déguisant en êtres humains. Créatures immortelles qui se nourrissent de sang, elles se cachent parmi nous. Une organisation appelée le Bouclier rouge mène une guerre privée pour les anéantir. Maintenant, la lutte s'est amplifiée. Saya Otonashi est une lycéenne normale qui souffre d'amnésie ; elle ne se souvient de rien avant la dernière année de sa vie. Puis un jour, un homme nommé Hagi apparaît et lui donne un katana, et son destin n'est que partiellement révélé. Le voyage vers la vérité commence...