Soren ( Jim Sturgess ), une jeune chouette effraie, est kidnappée par des hiboux de St. Aggie's, apparemment un orphelinat, où les hiboux subissent un lavage de cerveau pour devenir des soldats. Lui et ses nouveaux amis s'échappent sur l'île de Ga'Hoole, pour aider ses nobles et sages hiboux qui combattent l'armée créée par les méchants dirigeants de St. Aggie's.