Accelerator est considéré comme le médium le plus puissant d'Academy City et l'un des rares capables de passer au niveau 6. Cependant, il mène maintenant une vie paisible et tente de se remettre de ses blessures passées. Son repos est interrompu, lorsqu'un groupe de voyous au sein d'Anti-Skill appelé DA, obsédé par le fait de rendre justice à Academy City, au point d'opter pour des enlèvements et des expériences sur des humains, provoque de purs ravages dans la ville. Bien qu'Accelerator n'aime pas être dérangé et déteste les problèmes, l'action disciplinaire, ou DA, est une menace suffisante pour qu'Accelerator prenne des mesures, principalement en raison du fait que le groupe, pour une raison inconnue, tente de kidnapper The Last Order. Désormais, seul Accelerator peut sauver Academy City et The Last Order des fanatiques zélés travaillant dans DA.