"Code Lyoko" racconta la storia di un gruppo di studenti che scoprono un universo parallelo chiamato Lyoko all'interno di un supercomputer minacciato da un programma rinnegato chiamato XANA che potrebbe distruggere il mondo. Spetta a quattro studenti di collegio di nome Jeremy, Yumi, Ulrich e Odd aiutare un essere umanoide all'interno di Lyoko di nome Aelita a fermare il programma canaglia XANA e i suoi piani per attaccare il loro mondo. Jeremy, che è innamorato di Aelita, lotta durante la prima stagione per trovare un modo per "materializzare" Aelita, in modo che possa diventare umana uscendo dagli scanner che collegano Odd, Ulrich e Yumi a Lyoko. Se Jeremy riesce a farlo, sarà in grado di arrestare Lyoko e sconfiggere XANA. Assistiamo che Jeremy finalmente materializza Aelita e realizza il suo sogno. Il gruppo ha disattivato Lyoko, ma XANA apparentemente ha infettato Aelita con un virus prima che si materializzasse, quindi se XANA se ne va, lo fa anche lei! All'inizio della stagione 2, assistiamo all'alba della nuova tecnologia. Jeremy programma i veicoli in Lyoko per ...