È passato un anno dagli eventi di Final Fantasy VII: Advent Children. Sepolto vivo in seguito al disastro Meteor, un misterioso gruppo noto come Deep Ground Soldiers emerge e inizia a razziare la città di Midgar. L'enigmatico Vincent Valentine è in qualche modo collegato a questi attacchi e potrebbe essere anche l'unico che può salvare questo mondo in frantumi. Altri personaggi di Final Fantasy VII e Final Fantasy VII: Advent Children si uniscono a Vincent nel suo viaggio per salvare l'unica potente città di Midgar e man mano che la storia si svolge, sarai testimone di una fiducia scioccante mai rivelata prima in Final Fantasy VII ...