Quando un boss della Yakuza di nome Anjo scompare con 300 milioni di yen, il suo braccio destro, un uomo sadomasochista di nome Kakihara, e il resto dei suoi scagnozzi vanno alla sua ricerca. Dopo aver catturato e torturato un membro rivale della Yakuza in cerca di risposte, si rendono presto conto di aver preso la persona sbagliata e iniziano a cercare l'uomo di nome Jijii che li ha informati in primo luogo.
Ben presto Kakihara e i suoi uomini incontrano Ichi, un giovane psicotico e sessualmente represso con incredibili abilità nelle arti marziali e lame che escono dalle sue scarpe. Uno per uno Ichi elimina i membri della Yakuza e nel frattempo Kakihara intensifica la sua ricerca di Ichi e del suo controllore Jijii.
Cosa succederà quando avverrà lo scontro finale tra il torturato e ultra-violento Ichi e il desideroso di dolore Kakihara?