Mentre Marcus (Andre Braugher) e Sam (Scott Speedman) cercano il traditore nei loro ranghi che ha rubato la loro chiave di lancio nucleare, Prosser (Robert Patrick) disobbedisce agli ordini e inizia una piccola guerra che non può controllare. Nel frattempo Grace e James devono lavorare insieme per disinnescare una situazione pericolosa, mentre a Washington Christine è incriminata come co-cospiratrice di Sam.