La diciottenne Yoko Godai (Yoko Minamino) è appena andata in pensione dal suo incarico come agente speciale di brandendo yo-yo, nome in codice Saki Asamiya (alias Sukeban Deka), e ora sta studiando per gli esami di ammissione all'università. Questa pace ritrovata si interrompe bruscamente quando incontra un giovane che cerca di abbattere un gruppo di facist che mira a rovesciare il governo addestrando i giovani in una scuola privata militarizzata. Yoko assume nuovamente il ruolo di Sukeban Deka, reclutando vecchi e nuovi amici per un'ultima missione.