Ambientato in un piccolo villaggio, la storia di Varikkuzhiyile Kolapathakam ruota attorno alla vita di un giovane parroco, Vincent Kombana e alle 40 famiglie che vivono nel villaggio. Il padre è intelligente, amorevole e affettuoso verso le persone e, in cambio, anche loro lo rispettano e lo amano molto. Tutto va bene per gli abitanti del villaggio, fino a quando, un giorno, il padre assiste a un omicidio nel posto del villaggio che i criminali tengono rinchiuso il padre in un luogo segreto per nascondere il crimine. Il prete rivelerà la verità ai villaggi? Assicurerà il criminale alla giustizia?