Professor Charles Francis Xavier, che ha la capacità mutante di leggere le menti, cerca nuovi mutanti da addestrare su come utilizzare i loro poteri per il bene e per evitare che i mutanti si facciano del male e facciano del male agli altri presso la sua Scuola per Giovani Dotati.
Il suo avversario, Magneto "Maestro del Magnetismo", sta facendo la stessa cosa, ma per scopi malvagi. Ha reso Mystique, una mutaforma, preside della sua scuola superiore per radunare mutanti malvagi e prepararli alla guerra contro i non mutanti.
La trama più interessante della storia è che tutti gli eroi e i cattivi frequentano la stessa scuola superiore. La classica battaglia tra il bene e il male è ricominciata.