Yui Kusanagi sempre esteve perto dos deuses - mas agora ela está mais perto do que nunca! Zeus, o deus grego do céu e do trovão, arrasta-a para uma academia projetada para forçar os deuses a fortalecerem suas relações com os humanos (que enfraqueceu lentamente com o tempo). Ela é apresentada a Apollo (deus grego do sol), Hades (deus grego do submundo), Takeru / Susanoo (deus japonês do oceano), Tsukito / Tsukiyomi (deus japonês da lua), Balder (deus nórdico da luz ), Loki (deus nórdico do fogo), Thor (deus nórdico do trovão) e Dionísio (deus grego do vinho e da alegria). Zeus diz a seus companheiros deuses que eles terão um ano para fortalecer o vínculo / compreender as emoções humanas quando o ano terminar, ou todos permanecerão na escola pelo resto da eternidade (incluindo Yui).