Quatro cientistas são sequestrados por gangsters inescrupulosos de um sindicato que obriga os cientistas a desenvolver um programa de guerra bacteriológica. Existem apenas alguns que podem lidar com o Sindicato! O Batalhão Ninja está empenhado e deve encontrar a localização dos cientistas, libertá-los e erradicar o Syndikat. Seus oponentes implacáveis são os profissionais do serviço secreto das Potências Orientais.