Tita Mu Koshigaya é uma jovem capitã de um navio, o Cha-Cha Maru, cujo negócio é capturar criaturas exóticas no 'mar de nuvens' do planeta Ietta e vendê-las a colecionadores e zoológicos. Por acaso, ela salva Elysse Aldo Mordish, uma jovem de sua idade, de uma facção desonesta das próprias forças militares de Ietta, liderada pelo comandante blindado Guizel, que já matou o pai cientista de Elysse. Enquanto os militares conduzem uma perseguição viciosa para Elysse, torna-se aparente que ela possui a chave para um segredo que pode determinar o destino da independência de todo o planeta.