Quando ameaças de um movimento separatista são colocadas na República, a ex-rainha e agora senadora Padme Amidala se torna o alvo. O Mestre Jedi Obi-Wan Kenobi e seu aprendiz Anakin Skywalker são solicitados a protegê-la. Mas à medida que as ameaças do movimento ficam mais fortes e um exército secreto de clones está sendo desenvolvido, demandas são necessárias para entender quem está por trás desse exército de clones e por que eles estão atacando Padmé e a República.