Marvel Comics evreninde, mutantlar, genetik olarak süper güçlere sahip insanlar, nefret dolu ve korku dolu bir kalabalık tarafından zulmediliyor. Bundan bir sığınak, Profesör Xavier'in Üstün Yetenekli Çocuklar Akademisi. Ancak okulun, mutantların yeteneklerini kontrol etmeleri ve böylece normal toplumda işlev görmeleri için bir eğitim merkezi olarak gizli bir işlevi vardır. Aynı zamanda, hem mutantların olumlu bir örneği olarak oluşturulan X-Men adlı bir süper kahraman ekibinin gizli bir karargahı olarak hem de dünyayı algılanan üstünlüklerine diz çökmeye zorlayan mutantlara karşı bir karşı güç olarak hizmet eder. Bu dizi, Magneto, Apocalypse ve Sentinels olarak bilinen soykırım robotları gibi kötü adamlarla savaşırken, dünyanın onları kabul etmesi için mücadele ederken maceralarını anlatıyor.