YAKUZA PRINCESS spielt in der weitläufigen japanischen Gemeinde Sao Paulo in Brasilien - der größten japanischen Diaspora der Welt - und folgt Akemi (MASUMI), einer Waise, die entdeckt, dass sie die Erbin der Hälfte des Yakuza-Verbrechersyndikats ist. Akemi schmiedet eine unbehagliche Allianz mit einem amnesischen Fremden (Jonathan Rhys Meyers), der glaubt, dass ein uraltes Schwert ihre beiden Schicksale bindet, und muss einen Krieg gegen die andere Hälfte des Syndikats entfesseln, die ihren Tod will.