En un mundo alternativo, un pequeño porcentaje de niños puede manifestar superpoderes al llegar a la pubertad. Yuu Otosaka, un niño que despierta la capacidad de poseer temporalmente a otros, espera usar su poder para vivir una vida tranquila en la escuela secundaria. Sin embargo, es sorprendido in fraganti por la misteriosa Nao Tomori y se ve obligado a trasladarse a la Academia Hoshinoumi, donde él y los otros miembros del consejo estudiantil deben ayudar a los estudiantes que tienen problemas para controlar sus habilidades.