Em um mundo alternativo, uma pequena porcentagem de crianças é capaz de manifestar superpoderes ao atingir a puberdade. Yuu Otosaka, um menino que desperta a capacidade de possuir temporariamente outras pessoas, espera usar seu poder para levar uma vida fácil de colégio. No entanto, ele é pego em flagrante pelo misterioso Nao Tomori e é forçado a se transferir para a Hoshinoumi Academy, onde ele e outros membros do conselho estudantil devem ajudar os alunos que têm problemas para controlar suas habilidades.