Digimon Frontier introduce un nuevo universo en la franquicia de Digimon. Cinco niños del Mundo Real han sido llamados al Mundo Digital para adquirir los "espíritus legendarios" y salvar el Mundo Digital de uno de los 3 Ángeles Sagrados, Cherubimon, quien se ha rebelado contra los otros dos. Takuya, el héroe, Kouji, el solitario, Izumi, la chica, Junpei, el alivio cómico, y Tomoki, el niño pequeño, son los 5 Niños Elegidos del Mundo Real que deben usar los espíritus legendarios para "Evolucionar en Espíritu" en los guerreros legendarios mismos. ¿Podrán descubrir el secreto detrás de la rebelión de Cherubimon antes de que sus propios guerreros legendarios los eliminen?