El lince desaparecido nos cuenta la historia de un grupo de animales del que planean escapar de Noe. Noe es un viejo multimillonario excéntrico que quiere construir su propio arco de Noe para salvar a los animales en peligro de extinción. Este anciano recluta a Newmann, que es el mejor cazador del mundo. Este personaje solo quiere que le paguen sus servicios pero, incluso con su reputación, encuentra algunos problemas en su tarea. Félix, un lince ibérico con tanta mala suerte (principal motivo por el que cree que es una especie en peligro de extinción) que es el líder de un extraño grupo de animales intenta enfrentarse a las intenciones de Newmann y liberar a las especies capturadas.