Gosick se desarrolla en el país europeo ficticio de Sauville en la década de 1920. Kazuya Kujo es un estudiante transferido a la Academia St. Marguerite, un lugar donde abundan los mitos y las supersticiones. Mientras está allí, se encuentra con Victorique, una chica misteriosa pero muy inteligente que pasa sus días en la reclusión de la biblioteca leyendo todo su contenido o resolviendo misterios que los detectives locales no pueden resolver.