Till Lindemann y Richard Kruspe confirmaron que la canción era una referencia a sus infelices relaciones infantiles con sus propias madres. La letra cuenta la historia de un niño que no nació de un útero sino en un experimento, por lo que no tiene un verdadero padre o madre. La letra describe su plan de matar tanto a la madre "que nunca le dio a luz" como a él mismo, plan que procede a llevar a cabo. El video de "Mutter" sigue la trama de la canción, en la que el personaje mata a su madre y luego arroja su cuerpo a un río, terminando con el personaje en una jaula o calabozo que se coloca en el suelo.