A canção foi confirmada por Till Lindemann e Richard Kruspe como uma referência aos relacionamentos infelizes de sua infância com suas próprias mães. As letras contam a história de uma criança que não nasceu de um ventre, mas em um experimento, portanto, sem pai ou mãe verdadeiros. A letra descreve seu plano para matar tanto a mãe "que nunca o deu à luz" quanto a si mesmo, um plano que ele prossegue executando. O vídeo de "Mutter" segue o enredo da música, em que o personagem mata sua mãe e, em seguida, joga seu corpo em um rio, terminando com o personagem em uma gaiola ou masmorra que fica no chão.