Chise es una estudiante de secundaria pequeña, tímida y torpe que logró reunir el valor para pedirle a Shuji, un chico alto, seguro y atlético de su clase, que fuera su novio. Los dos forman una linda pareja, pero sus vidas, tal como las conocen, se desmoronan cuando la guerra comienza a destrozar a Japón. Aún más horrible, Chise es secuestrada por un grupo desconocido y su cuerpo se transforma en el arma definitiva de los militares. Con el conocimiento de en lo que se ha convertido su novia, Shuji lucha por aferrarse a la Chise que ama, incluso cuando los militares la usan para sus batallas y el resto de sus amigos también se ven involucrados en el creciente conflicto. Mientras tanto, Chise lucha por aferrarse a su humanidad, temerosa de que ella misma, como arma, un día pueda abrumarse y destruirse a sí misma como humana.