Ayumu Narumi, un estudiante de primer año contemplativo en la escuela secundaria, encuentra que su vida cambia cuando lo culpan por la caída de una niña de un edificio escolar. Usando solo una observación aguda y su asombroso talento para la lógica deductiva, pronto descubre la verdad detrás del incidente y se aclara, para asombro de su hermana detective de la policía y Kiyono Yuizaki, el emprendedor presidente del Club de Periodismo. Ese caso demuestra ser el comienzo de una extraña serie de crímenes que Ayumu descubre que es obra de los misteriosos Blade Children. A pesar de las objeciones de su hermana, investiga estos crímenes con la ayuda de Kiyono, quien tiene una gran astucia propia. Mientras tanto, los Niños de la Espada se enteran de su nuevo oponente y se dispusieron a detenerlo en forma de acertijos de lógica mortal que tomarán toda la brillantez de Ayumu para frustrarse. Mientras tanto, descubre oscuros secretos sobre sí mismo, los Niños y su conexión con ellos.