Un responsable local hutu est persuadé de mettre en œuvre la politique du gouvernement contre les Tutsis : les éliminer complètement. Josette, une belle jeune fille tutsie lutte pour survivre à la tuerie en se réfugiant dans une église, soi-disant protégée par les forces de l'ONU. Pendant ce temps, le frère de Josette est traqué et assassiné et son petit ami secouru par les rebelles. Mais le prêtre catholique hutu trahit la famille de Josette et n'accepte d'épargner sa vie que de se soumettre aux violations nocturnes. Au moment où elle retrouve son petit ami, aucun d'eux ne peut faire face à la réalité brutale de leur situation : elle est enceinte et porte l'enfant du prêtre, qu'elle abandonne immédiatement. 100 Days a été tourné à Kibuye, le paysage magnifique avait été la toile de fond de certaines des pires atrocités de 1994. Dans l'église de Kibuye, le site d'un véritable massacre, des acteurs rwandais ont joué des tueurs et des victimes qui ne leur étaient que trop familiers.