Nous sommes en 2027, huit ans après la première épidémie de The Sickness, un virus hautement contagieux, adaptatif et mortel. Le monde est désormais dirigé par une société pharmaceutique appelée The Company, qui distribue un traitement contre le virus mais le facture au prix fort, mettant la majorité des gens dans un état de pauvreté et de dépendance. David Oscar a fini de se battre. Il a perdu tout espoir et se cache dans une petite clinique clandestine. David est un ancien membre de The Flux, un mouvement rebelle décrit comme une organisation terroriste dans les médias. The Flux pense que The Company elle-même est responsable de The Sickness. Après des années à se cacher de son passé, David est retrouvé par des membres de The Flux, qui le persuadent de participer à une mission importante qui, selon eux, conduira à un remède contre The Sickness. Ce qu'ils découvrent, en pénétrant par effraction dans une installation sécurisée de The Company, n'est pas un remède à la maladie, mais seulement une jeune fille appelée Molly. Elle a été retenue captive et a été soumise à des expériences de la Compagnie pendant des années. Alors que David et ses compagnons aident Molly à s'échapper des installations de la société, la mutation à l'intérieur de son corps se manifeste et les membres de Flux découvrent pourquoi elle a été gardée sous clé pendant des années.