Une catastrophe temporelle massive frappe en l'an 2399. Une grande partie de la Fédération est détruite et la Terre est un désert volcanique. Désespérée de restaurer le présent, la capitaine Kendra Ronston retrouve son équipage fracturé et voyage dans le passé pour réparer les dégâts. Mais l'attendre est l'ennemi le plus sinistre que la Fédération ait jamais connu, et pour l'arrêter, elle devra faire appel à une source inattendue.