L'élève du secondaire Ling Xiaoyu est recrutée par Anna Williams de G Corporation pour être transférée à l'Université de Kyoto et recueillir des informations sur un étudiant nommé Shin Kamiya. Pendant ce temps, Jin Kazama, l'actuel chef de la Mishima Zaibatsu, envoie Alisa Bosconovitch à l'université pour la même mission. Bien qu'ils ne connaissent pas les véritables motivations de l'autre, Xiaoyu et Alisa deviennent des amis proches. Cependant, leur amitié est mise à l'épreuve lorsque Shin est capturé par un agresseur inconnu.