Un trou noir menace l'univers, Optimus Prime et les Autobots doivent se réfugier sur Terre et cacher leur existence aux habitants. Les Autobots reçoivent la visite de l'ancien Autobot nommé Vector Prime qui leur dit que le seul moyen d'arrêter le trou noir est de trouver les 4 clés de la cyberplanète. Cependant, le méchant Megatron et ses Decepticons sont également à la recherche des Cyber Planet Keys. Ils devront trouver leurs emplacements sur Terre, Speed Planet, Jungle Planet et Giant Planet pour déterminer le destin de l'univers.