Sin da quando era piccolo, Takashi Natsume è stato in grado di vedere ciò che gli altri non potevano vedere, vale a dire gli spiriti mostruosi conosciuti come Yokai. La defunta nonna di Natsume, Reiko, sfidava Yokai a delle gare e coloro che perdevano dovevano firmare un contratto con lei, allegando i loro nomi al suo "Yujin-cho". Da quando Natsume ha ereditato il libro, insieme a Nyanko Sensei, la sua autoproclamata guardia del corpo, trascorre le sue giornate cercando di restituire i nomi all'interno del libro ai loro proprietari. Natsume è stato impegnato a navigare tra gli umani e Yokai quando casualmente incontra una vecchia compagna di classe, Yuki. Riporta ricordi dolorosi di un certo Yokai. Nel frattempo, Natsume ha anche incontrato Yorie Tsumura, una donna nella memoria di uno Yokai a cui aveva restituito il nome. Yorie sapeva molto di Reiko, ma ora viveva una vita tranquilla con il suo unico figlio, Mukuo. Stare con questa famiglia è stato confortante per Natsume, ma a quanto pare un misterioso Yokai è in agguato nella loro città. Al ritorno da...