Quando Sonic the Hedgehog trova un misterioso ascensore spaziale, lui e il suo migliore amico Miles Tails Power ci entrano e scoprono che il malvagio dottor Eggman ha di nuovo i suoi vecchi trucchi. Eggman ha catturato una specie aliena malvagia chiamata "Wisps" e il suo tentativo di sfruttare il loro potere chiamato "Hyper go ons" in modo da poter costruire un'arma per il controllo mentale in modo che le persone obbediscano a ogni suo comando, quindi spetta a Sonic, Tails e nuovi ha trovato il compagno Yacker per salvare la vita più intelligente là fuori.