Als Sonic the Hedgehog einen mysteriösen Weltraumaufzug findet, gehen er und sein bester Freund Miles Tails Power hinein und entdecken, dass der böse Dr. Eggman wieder seinen alten Tricks gewachsen ist. Eggman hat eine böse außerirdische Spezies namens "Wisps" gefangen und versucht, ihre Macht namens "Hyper go ons" zu nutzen, damit er eine Waffe zur Gedankenkontrolle bauen kann, damit die Leute jedem seiner Befehle gehorchen. Es liegt also an Sonic, Tails und neu fand den Gefährten Yacker, um das intelligentere Leben da draußen zu retten.