L'anno è il 2054 e 2 specie aliene hanno scelto la Terra come campo di battaglia per la loro guerra. L'umanità ha tentato di reagire, usando mech chiamati Skells, ma non ha potuto resistere. Percependo la distruzione della Terra, i governi scelgono per l'umanità di evacuare la Terra su un grande veicolo spaziale noto come la "balena bianca". Tuttavia, furono inseguiti da una delle razze aliene e, trascinata nel campo gravitazionale di un pianeta vicino, la nave si divise e si schiantò. Miracolosamente, c'erano molti sopravvissuti, ma molti di loro si sono persi in luoghi intorno al pianeta, ora conosciuti come "Mira". Il personaggio principale personalizzabile, Cross, è un sopravvissuto trovato in una capsula di stasi a Primordia, il continente in cui è stata precipitata l'intera città di New Los Angeles.