Em um futuro distante, guerra e paz caminham lado a lado no lugar pseudo-utópico chamado Jesus Town (antiga Jerusalém), governado por um serafim bonito, mas cruel chamado Girjev e seu companheiro androide, Mikhail, anseiam por paz total. Selado longe da civilização há muito tempo está um andróide, codinome Hakaider. Como sua memória está enferrujada, ele não conhece seu verdadeiro propósito. Após sua luta com os motociclistas de Jesus Town, Kaoru e seu bando de rebeldes o encontram. Ele enlouquece mais uma vez e começa a chicotear os rebeldes um por um, apenas para matá-los por mais tropas de Girjev, todos exceto Kaoru. Hakaider então recupera sua memória, graças a Kaoru, a quem ele começa a gostar e promete libertar Jesus Town de Girjev e Mikhail.