Uma descoberta no futuro próximo torna possível criar clones humanos geneticamente modificados e aprimorados. As consequências dessa descoberta resultam em um caos bioético. Para corrigir esse erro, a Organização Mundial da Saúde impõe uma proibição global de toda atividade de clonagem humana.
Um grupo de cientistas da Corporação Nova, líder em pesquisa de clonagem, fez avanços milagrosos na replicação de seres humanos. Quando um de seus colegas, um cientista louco chamado Dr. Oh, cria uma "Cepa de Obediência" que lhe permitirá controlar a mente dos clones, a Nova Corp o expulsa e revoga sua licença.
Dr. Oh jura vingança contra seus três parceiros, Drs. Markov, Forster e Hillier, e cria um clone que é a máquina de matar perfeita, Takeru, um clone ninja assassino. Enquanto isso, a Nova Corp descobre o plano do Dr. Oh e envia um caçador de recompensas, Madsen, para destruir o Dr. Oh, o laboratório do Dr. Oh e quaisquer clones que ele possa ter desenvolvido.
Madsen tem muito trabalho pela frente, pois com Takeru à solta, é apenas uma questão de tempo antes que o clone os encontre a todos!