Amen, eski bir Nasrani Kilisesi çevresindeki insanların hikayesini anlatıyor. Konu, sakinlerinin her zaman beyaz giyindiği Kumarankary köyünde geçiyor - filmin fantezi ve maneviyat unsurlarını birleştirmek için ustaca kullandığı bir motif. Genç, yakışıklı bir din adamı (Indrajith Sukumaran), kıdemli Kathanar Fr. olan kilisenin Kathanar (Suriyeli rahip) olarak gelir. Abraham (Joy Mathew), huysuz bir adam. Köyün, Solomon (Fahadh Faasil) ve Sosanna (Swati Reddy) arasındaki aşktan, yarışmalarda sık sık başarısız olan bir grubun kaderine kadar değişen bir dizi sorunu var. Film kendisine Süleyman'ın aşkının kaderi, daha önce bilmediği bir özelliği göz kamaştırıcı bir şekilde keşfetmesi ve bazı ciddi manevi ve dini çatışmalar gibi birçok hedef koyuyor. Amen, müzik, inanç, fantazi ve romantizm ve inanılmaz derecede çeşitli karakterlerle dolu bereketli bir arsa vaat ediyor. Cemaat, önceki bando yarışmasında rakip gruba kaybeden kilise bandosunu elinde tutup tutmamayı ciddi bir şekilde tartışırken, genç bir rahip Fr. Vincent Vattoli (Indrajit), Fr.Ottaplackan'ın sorumluluğunu üstlenir. Tarz sahibidir, geleneklere meydan okumaya cesaret eder ve Solomon ile Sosanna arasındaki romantizmi destekler. Hareketleri kıdemli rahibi rahatsız eder ve işler bir süre sonra ciddi bir hal alır. Halk, Süleyman'ın Sosanna'ya olan aşkının kaderini ve Kumarankary kilise çetesinin geleceğini belirleyen bir anlaşmayı kabul eder. Grup yarışmayı kazanmaya devam ediyor ve film gerçekten şaşırtıcı bir dorukta bitiyor.