Kopenhag, Danimarka, 1926. Einar Wegener (Eddie Redmayne tarafından canlandırılıyor) ve karısı Gerda (Alicia Vikander) mutlu evli bir çift. İkisi de sanatçı, Einar manzaraları ve portreleri tercih ediyor. Bir gün Einar, elbisesiyle Gerda'nın portresi için poz verir. Bu, başlangıçta bir şaka gibi yapılır, daha sonra bir kadın gibi giyinmiş bir partiye katılım gibi. Ancak, Einar çok geçmeden onun aslında bir kadın olduğunu keşfeder ve zamanla Lili olmayı tercih eder. İlk başta o ve Gerda durumunu "tedavi ettirmeye" çalışırlar, ancak bu hiçbir yere varmaz (birçok doktorun Lili'yi bir sapık ve/veya deli olarak hapsetmeye çalışması dışında). Kendini keşfetme yolculuğu, nihayetinde ilk cinsiyet değiştirme operasyonu geçirmesine yol açacaktır.