CBS'nin başarılı CSI franchise'ı Big Apple'a nakledilir. Tanık olarak lağım farelerini içeren davalar, kafası pizza fırınına çarpılmış bir kurban ve emtia tüccarlarının cinayetleri ve tabii ki bir Red Sox hayranı. CSI: NY, Las Vegas ve Miami kuzenlerinin daha kasvetli, daha kasvetli bir versiyonu. Ekip, hoş bir New Yawk ama belirsiz karakterlerden oluşuyor. Ekip lideri Dedektif Mac Taylor (Gary Sinise), Chicago'dan eski bir denizcidir. Mac, karısını 11 Eylül'de kaybeden bir NYPD gazisi ve bu nedenle ekibini denetlerken kişisel hayatını yeniden inşa etmek için çalışması gerekiyor. Yönetim tarzında organize, verimli, kendini adamış ve çok uygundur. İlk 6 sezondaki ikinci komutanı Dedektif Stella Bonasera (Melina Kanakaredes), Stella yarı Yunan, yarı İtalyan ve tamamen New York'lu. Karısının ölümünün etkisiyle Mac'e yardım etti ve o zamandan beri onun yanında. Bilgili bir araştırmacıdır, ancak çoğu zaman düşünmeden önce konuşur. Stella, New Orleans'taki bir suç laboratuvarının başına geçmek üzere New York'tan ayrılır ve yerine Dedektif Jo Danville (Sela Ward) geçer. Jo, eski bir FBI suçlusu ve deneyimli bir psikolojik profil uzmanıdır. O ve Mac hızla güçlü bir dostluk ve daha da güçlü bir çalışma ilişkisi kurarlar. Jo'nun uygunsuz laboratuvar prosedürü hakkında ihbarda bulunduktan sonra FBI'dan kovulması hâlâ peşini bırakmıyor, bu yüzden profesyonel itibarını yeniden kazanmak için çalışıyor. Onlara katılan genç CSI'ler Danny Messer (Carmine Giovinazzo), Aiden Burn (o zamandan beri şovu bırakan Vanessa Ferlito), Aiden'ın yerini alan Lindsay Monroe (Anna Belknap) ve adli tabip CSI'den Sheldon Hawkes (Hill Harper) oldu. Oyuncu kadrosunu tamamlayan ekipler, cinayet masası dedektifi Don Flack (Eddie Cahill), Medical Examiner Sid Hammerback, M.D. (Robert Joy) ve laboratuvar teknisyeni Adam Ross (A.J. Buckley).