Sonic the Hedgehog ve yardımcıları Tails ve Knuckles the Echidna, Göklerin Ülkesini, yüzeyin altında gizlenen (ve tabii ki eski Dünya gezegeni olan) Karanlığın Ülkesi'nin eşdeğerine dönüştürecek bir planı engellemeye kararlılar. Bu yüzden, adil bir savaş yapmak için gezegenin merkezine ve antik Robotropolis şehrine (eski New York? Günün büyük sorusu, genellikle kötü olan Dr. Robotnik'in bir kereliğine doğruyu mu söylüyor yoksa iyi adamları bir tuzağa mı gönderiyor?