2009. Toma Saya ve Sebumi Takeru'nun tanışmasından bir yıl önce. Toma Saya, FBI'dan eğitim aldıktan sonra Japonya'ya yeni döndü ve Kamu Güvenliği Bürosunda soğuk vakalarda çalışmaya başladı. Bir petrol şirketinin üst düzey yöneticilerinin birileri tarafından kalpleri çarpıldığı için gizemli bir şekilde öldüğü bir vakayı araştıran Toma Saya, kendisine ve Sebumi Takeru'ya meydan okumaya devam edecek olan düşmanı Ninomae Juichi ile tanışır. SPEC hikayesi buradan başlıyor.