Geologe Dr. Carl Maia befindet sich auf einer Expedition im oberen Amazonasbecken und entdeckt ein Fossil, das in einem Felsen eingebettet ist - die Klaue eines unbekannten Wesens, das zeigt, dass es mächtig war. Mit Merkmalen des amphibischen Wesens konsultiert er unter anderem einen ehemaligen Studenten, den Ichthyologen Dr. David Reed, der derzeit für ein Meeresbiologie-Institut in Brasilien arbeitet.
Dr. Maia kann nicht nur David, sondern auch andere vom Institut überzeugen, sich der Expedition anzuschließen, um den Rest des Fossils zu entdecken. Das Team umfasst Davids Chef Dr. Mark Williams und Marks Forschungsassistentin Kay Lawrence, die auch Davids Freundin ist. Mark stimmt der Finanzierung der Expedition zu, da er ehrgeizig ist und oft die Anerkennung für bedeutende Forschung am Institut erhält, was ihn oft mit David in Konflikt bringt.
Als sie am Fundort des ursprünglichen Fundes arbeiten, um den Rest des Fossils ohne Erfolg zu finden, beginnt David aufgrund geologischer Beweise zu glauben, dass es weiter flussaufwärts des Zuflusses am sogenannten Schwarzen Lagune sein könnte. Letztendlich entdecken sie, dass ein solches Wesen immer noch in der Lagune existiert.
Die Feindseligkeit zwischen David und Mark, die sich auf dieser Expedition fortsetzt, könnte sich als tödliche Kombination für einige oder alle Mitglieder des Teams erweisen, wenn sie darüber entscheiden, was sie mit dem potenziell tödlichen Wesen tun sollen.