Es ist an der Zeit, dass die Menschen sich von den Klauen der Vulkanier lösen, die hundert Jahre nach der Erfindung des Warpantriebs und dem ersten Kontakt mit ihnen (den Vulkanier) immer noch nicht in der Lage sind, in den Weltraum zu warpen, um zu erkunden.
Glücklicherweise führt ein unheimlicher Vorfall mit den Tsuliban (in der ersten Folge der Serie) dazu, dass die Enterprise - unter dem Kommando von Captain Jonathan Archer - ihre erste Reise mit Warpgeschwindigkeit unternimmt.
Captain Archer wird dann einer Reihe von Herausforderungen ausgesetzt, während er nach dieser ersten Reise nach größerer Erkundung strebt.
Seine Kämpfe mit außerirdischen Kriegsschiffen, Wesen, die den Menschen überlegen sind, alternativen Universen und Zeitreisen (ohne den Luxus eines Transporters) lassen ihn herausragende Führungsqualitäten zeigen und die Loyalität der Kommunikationsoffizierin Hoshi, des Chefingenieurs Trip, des Waffenoffiziers Malcolm, des Fähnrichs Travis, des außerirdischen Arztes Phlox und des vulkanischen Unteroffiziers T'Pol gewinnen, der auf die Enterprise geschickt wurde, um ein Auge auf den Captain zu haben.