El arqueólogo y ávido solucionador de acertijos, el profesor Layton y su asistente Luke, recuerdan juntos uno de sus primeros casos ... La famosa cantante Janice Quatlane solicita la ayuda de Layton después de un extraño encuentro con una niña. La niña afirma poseer la vida eterna y ser la reencarnación de Melina, la amiga de Janice. Layton y Luke asisten a la nueva ópera de Janice. Al final de la actuación, los invitados se sorprenden al descubrir que toda la ópera se ha convertido en un barco y un hombre misterioso ahora los mantiene cautivos. El hombre los obliga a resolver una serie de acertijos. El ganador recibirá el secreto de la vida eterna, pero podría significar la muerte para los perdedores ...