Cuando Mothra fue al espacio exterior para evitar que un meteoro llegara a la Tierra, accidentalmente tomó células de Godzilla y las células restantes de Biollante que habitaban nuestra atmósfera. Las células combinadas pasaron por un agujero negro y crearon una nueva criatura, Space Godzilla. Space Godzilla se dirige a la Tierra para enfrentarse a Godzilla, Junior Godzilla y el nuevo robot G-Force, MOGERA.